Как установлено приговором суда, 12 мая 2006 года в своем служебном кабинете подполковник Шалагин избил офицера милиции Леонида Сарри. Руководство УБОП требовало от своего сотрудника дать ложные официальные показания против одного из сотрудников Управления собственной безопасности ГУ МВД по Приволжскому федеральному округу.
Адвокат Леонида Сарри обратился за помощью в Комитет против пыток, юристы которого, проведя проверку по его заявлению, оказали помощь Леониду Сарри, в том числе добились передачи официального расследования из Чувашской прокуратуры, чья объективность, по мнению Комитета, вызывала сомнение, в прокуратуру Татарстана, которая и довела уголовное дело в отношении Шалагина до суда.
Вынесенный в апреле приговор был обжаловал адвокатами высокопоставленного милицейского начальника в кассационном порядке, однако Верховный Суд Чувашии оставил приговор в силе.